Polygenic transmission disequilibrium confirms that common and rare variation act additively to create risk for autism spectrum disorders - Faculté des Sciences de Sorbonne Université
Article Dans Une Revue Nature Genetics Année : 2017

Polygenic transmission disequilibrium confirms that common and rare variation act additively to create risk for autism spectrum disorders

Daniel J Weiner (1, 2, 3) , Emilie M Wigdor (1, 2, 3) , Stephan Ripke (1, 2, 3, 4) , Raymond K Walters (1, 2, 3) , Jack A Kosmicki (1, 2, 3) , Jakob Grove (5, 6) , Kaitlin E Samocha (2, 1, 3) , Jacqueline I Goldstein (2, 1, 3) , Aysu Okbay (7) , Jonas Bybjerg-Grauholm (6, 8) , Thomas Werge (6, 9) , David Hougaard (8) , Jacob Taylor (2, 1, 3) , Marie Bækvad-Hansen , Ashley Dumont , Christine Hansen , Thomas Hansen , Daniel H Howrigan , Manuel Mattheisen , Jennifer Moran , Ole Mors , Merete Nordentoft , Bent Pedersen , Timothy Poterba , Jesper Poulsen , Christine S Stevens , Verneri Anttila , Peter Holmans , Hailiang Huang , Lambertus Klei , Phil H Lee , Sarah E Medland , Benjamin Neale , Lauren A Weiss , Lonnie Zwaigenbaum , Timothy W Yu , Kerstin Wittemeyer , a Jeremy Willsey , Ellen M Wijsman , Thomas Wassink , Regina Waltes , Christopher A Walsh , Simon Wallace , Jacob a S Vorstman , Veronica J Vieland , Astrid M Vicente , Herman van Engeland , Kathryn Tsang , Ann P Thompson , Peter Szatmari , Oscar Svantesson , Stacy Steinberg , Kari Stefansson , Hreinn Stefansson , Matthew W State , Latha Soorya , Teimuraz Silagadze , Stephen W Scherer , Gerard D Schellenberg , Sven Sandin , Evald Saemundsen , Guy A Rouleau , Bernadette Rogé , Kathryn Roeder , Robert Roberts , Jennifer Reichert , Abraham Reichenberg , Karola Rehnström , Regina Regan , Fritz Poustka , Christopher Poultney , Joseph Piven , Dalila Pinto , Margaret A Pericak-Vance , Milica Pejovic-Milovancevic , Marianne G Pedersen , Carsten B Pedersen , Andrew Paterson , Jeremy R Parr , Alistair T Pagnamenta , Guiomar Oliveira , John I Nurnberger , Michael T Murtha , Susan Mouga , Eric M Morrow , Daniel Moreno de Luca , Anthony P Monaco , Nancy Minshew , Alison Merikangas , William M Mcmahon , Susan G Mcgrew , Igor Martsenkovsky , Donna M Martin , Shrikant M Mane , Pall Magnusson , Tiago Magalhaes , Elena Maestrini , Jennifer K Lowe , Catherine Lord , Pat Levitt , Christa Lese Martin , David H Ledbetter , Marion Leboyer , Ann S Le Couteur , Christine Ladd-Acosta , Alexander Kolevzon , Sabine M Klauck , Suma Jacob , Bozenna Iliadou , Christina M Hultman , Irva Hertz-Picciotto , Robert Hendren , Christine S Hansen , Jonathan L Haines , Stephen J Guter , Dorothy E Grice , Jonathan M Green , Andrew Green , Arthur P Goldberg , Christopher Gillberg , John Gilbert , Louise Gallagher , Christine M Freitag , Eric Fombonne , Susan E Folstein , Bridget Fernandez , M Daniele Fallin , a Gulhan Ercan-Sencicek , Sean Ennis , Frederico Duque , Eftichia Duketis , Richard Delorme , Silvia de Rubeis , Maretha V de Jonge , Geraldine Dawson , Michael L Cuccaro , Catarina T Correia , Judith Conroy , Inês C Conceição , Andreas G Chiocchetti , Patrícia B S Celestino-Soper , Jillian Casey , Rita M Cantor , Cátia Café , Sean Brennan , Thomas Bourgeron , Patrick F Bolton , Sven Bölte , Nadia Bolshakova , Catalina Betancur (10) , Bernie Bernier , Arthur L Beaudet , Agatino Battaglia , Vanessa H Bal , Gillian Baird , Anthony J Bailey , Joel S Bader , Elena Bacchelli , Evdokia Anagnostou , David Amaral , Joana Almeida , Joseph D Buxbaum , Aravinda Chakravarti , Edwin H Cook , Hilary Coon , Daniel H. Geschwind , Michael Gill , Hakon Hakonarson , Joachim Hallmayer , Aarno Palotie , Susan Santangelo , James S Sutcliffe , Dan E Arking , David Skuse (11) , Bernie Devlin (12) , Richard Anney (13) , Stephan J Sanders (14) , Somer Bishop (14) , Preben Bo Mortensen (5, 6) , Anders D Børglum (5, 6) , George Davey Smith (15) , Mark J Daly (2, 1, 3) , Elise B Robinson (2, 1, 3)
Marie Bækvad-Hansen
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Ashley Dumont
Christine Hansen
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Thomas Hansen
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Daniel H Howrigan
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Manuel Mattheisen
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Jennifer Moran
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Ole Mors
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Merete Nordentoft
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Bent Pedersen
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Timothy Poterba
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Jesper Poulsen
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Christine S Stevens
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Verneri Anttila
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Peter Holmans
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Hailiang Huang
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Lambertus Klei
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Phil H Lee
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Sarah E Medland
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Benjamin Neale
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Lauren A Weiss
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Lonnie Zwaigenbaum
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Timothy W Yu
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Kerstin Wittemeyer
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a Jeremy Willsey
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Ellen M Wijsman
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Thomas Wassink
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Regina Waltes
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Christopher A Walsh
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Simon Wallace
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Jacob a S Vorstman
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Veronica J Vieland
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Astrid M Vicente
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Herman van Engeland
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Kathryn Tsang
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Ann P Thompson
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Peter Szatmari
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Oscar Svantesson
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Kari Stefansson
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Hreinn Stefansson
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Matthew W State
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Latha Soorya
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Teimuraz Silagadze
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Stephen W Scherer
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Gerard D Schellenberg
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Sven Sandin
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Evald Saemundsen
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Guy A Rouleau
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Bernadette Rogé
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Kathryn Roeder
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Robert Roberts
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Margaret A Pericak-Vance
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Marianne G Pedersen
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Carsten B Pedersen
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Jeremy R Parr
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John I Nurnberger
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Michael T Murtha
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Susan Mouga
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Eric M Morrow
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Daniel Moreno de Luca
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Anthony P Monaco
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William M Mcmahon
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Susan G Mcgrew
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Igor Martsenkovsky
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Donna M Martin
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Shrikant M Mane
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Christine Ladd-Acosta
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Christina M Hultman
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Christine S Hansen
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Stephen J Guter
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Hilary Coon
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Daniel H. Geschwind
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Michael Gill
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Hakon Hakonarson
Joachim Hallmayer
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Aarno Palotie
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Susan Santangelo
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James S Sutcliffe
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Dan E Arking
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Richard Anney
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Résumé

Autism spectrum disorder (ASD) risk is influenced by common polygenic and de novo variation. We aimed to clarify the influence of polygenic risk for ASD and to identify subgroups of ASD cases, including those with strongly acting de novo variants, in which polygenic risk is relevant. Using a novel approach called the polygenic transmission disequilibrium test and data from 6,454 families with a child with ASD, we show that polygenic risk for ASD, schizophrenia, and greater educational attainment is over-transmitted to children with ASD. These findings hold independent of proband IQ. We find that polygenic variation contributes additively to risk in ASD cases who carry a strongly acting de novo variant. Lastly, we show that elements of polygenic risk are independent and differ in their relationship with phenotype. These results confirm that the genetic influences on ASD are additive and suggest that they create risk through at least partially distinct etiologic pathways.
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Citer

Daniel J Weiner, Emilie M Wigdor, Stephan Ripke, Raymond K Walters, Jack A Kosmicki, et al.. Polygenic transmission disequilibrium confirms that common and rare variation act additively to create risk for autism spectrum disorders. Nature Genetics, 2017, 49, pp.978-985. ⟨10.1038/ng.3863⟩. ⟨hal-01546155⟩
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